Cuando el 2% de la población mundial desaparece de forma literal y abrupta, sin explicación alguna, quedando sólo sus ropas en el sitio en el que sus cuerpos se evaporaron, el resto de la población de la Tierra comienza a intentar comprender lo que ha pasado, y sobre todo lo que se supone que deben hacer al respecto. Uno de estas personas es el jefe de la policía de un pequeño suburbio de Nueva York, padre de dos hijos, que trata de mantener cierta apariencia de normalidad.
Un pueblo rebautizado como Milagro ha sido un imán para turistas después de descubrir que ninguno de sus habitantes desapareció. Entre los locales está la familia Murphy, cuyo padre, John, se encarga de alejar a los charlatanes del pueblo. Kevin, Nora y Jill llegan a este pueblo donde junto a los Murphy experimentarán un misterioso evento que cambiará sus vidas para siempre.
Kevin, Nora y Jill tienen un nuevo comienzo en la seguridad de Miracle. Ellos tratan de recuperarse de los estragos causados por los disturbios en Mapleton, pero dificultades del pasado resurgirán. Kevin se involucra en los problemas de la familia Murphy.
Después del terremoto, Kevin vuelve a casa pero no consigue recordar qué sucedió la noche anterior. Para empeorar las cosas, un viejo enemigo está de vuelta.
El reverendo Matt Jaminson lleva a su esposa en estado vegetal a Miracle para buscar respuestas respecto a su condición. Pero sus vidas dan un giro inesperado cuando les prohíben retornar a la ciudad.
Nora se enfrenta a un dilema sobre sí misma después de una pésima experiencia con unos visitantes inesperados. Los problemas de Kevin se vuelven imposibles de ignorar. Erika encuentra un aliado, al que le revela inquietantes secretos.
Nora tiene noticias para su nueva familia y Kevin se ocupa de las consecuencias de esta revelación, barajando sus opciones. Jill inicia una aventura en solitario que sólo podría ocurrir en Miracle. Laurie toma una decisión que afectará a los Garvey.
Ante la duda de Laurie sobre la salud mental de Kevin, éste intenta vencer a Patti en un inesperado campo de batalla. Una decisión terrible y desgarradora es todo lo que se interpone entre él y su oportunidad de deshacerse de ella, y de su pasado también.
Una pérdida personal y el peregrinaje posterior a Milagro arrojan luz sobre las razones que llevaron a Megan a su actual y radical camino dentro de los Remanentes Culpables. Tom se enfrenta a su madre y hace un revelador descubrimiento.
Final de temporada. Kevin vuelve a casa y confiesa a un escéptico John su papel en la desaparición de Evie, mientras los habitantes de Milagro se ven envueltos en una revuelta en pleno aniversario de la Marcha Repentina.